藻紅蛋白是波羅的海最具活力的浮游植物色素之一。葉綠素a提供有關(guān)散裝浮游植物生物量的信息，而藻藍(lán)蛋白反映了絲狀藍(lán)細(xì)菌的分布，而藻紅蛋白信號(hào)主要來(lái)源于微藍(lán)細(xì)菌，纖毛藍(lán)藻，隱藻，和一些鞭毛藻。

 2016 年起，藻紅蛋白熒光已使用Chelsea UniLux熒光計(jì)在芬蘭赫爾辛基和德國(guó)特拉夫明德之間的渡輪Finnmaid上進(jìn)行了可操作的測(cè)量，這是Alg@line渡輪箱項(xiàng)目和EU RIA 項(xiàng)目 JericoNEXT 中活動(dòng)的一部分。過(guò)去25年來(lái)，Alg@line一直在波羅的海進(jìn)行實(shí)時(shí)藻類(lèi)監(jiān)測(cè)，主要基于船箱的測(cè)量，并由芬蘭環(huán)境研究所SYKE負(fù)責(zé)實(shí)施。

2016年和2017年的藻紅蛋白熒光結(jié)果令人鼓舞，表明波羅的海中部藻紅蛋白熒光的早春分布，表明Mesodinium rubrum大量發(fā)生。在夏季晚些時(shí)候，藻紅蛋白熒光的起源與微藍(lán)藻細(xì)菌有關(guān)，從水樣進(jìn)行幾次參考測(cè)量就證明了這一點(diǎn)。The Finnish Environment Institute最近又購(gòu)買(mǎi)了三臺(tái)Chelsea UniLux熒光計(jì)，作為其他渡輪、研究船和剖面浮標(biāo)的測(cè)量系統(tǒng)的一部分，以獲取有關(guān)藻紅蛋白分布的更全面的信息。